重医大附一院外三科于2000年由重庆市卫生局批准成立重庆市胃肠外科疾病治疗中心。本中心擅长普外科疾病的诊断和治疗，尤其对胃肠外科疾病的诊断和治疗具有丰富的经验。对胃肠道肿瘤的早期诊断、胃癌术式的选择、直肠癌的保肛术式等进行了深入研究。率先在重庆市开展腹腔镜结直肠手术，直肠癌保肛率、胃肠道癌的生存率的生存率均属国内先进水平。此外对肿瘤的化疗以及肠内肠外营养支持等已形成一套完整的体系。

本中心技术力量雄厚，现有教授6人，副教授2人，主治医师多人。其中先后有1人曾赴德国科隆大学医学院留学，获医学博士学位；3人到日本鸟取大学医学部研修。本中心医疗设备完善、先进，拥有纤维胃镜、电子结肠镜、胃肠动力检查仪及多功能微波治疗仪等先进的检查治疗仪器。对胃肠道肿瘤的早期诊断、肛直肠动力学的检测等具有很大帮助。

本中心就诊指南：贲门癌、胃癌、胃平滑肌瘤、胃溃疡及穿孔、十二指肠溃疡及穿孔、十二指肠乳头腺瘤及癌伴梗阻性黄疸、上消化道出血；小肠肿瘤、小肠息肉、小肠梗阻；结肠癌、结肠多发性息肉、结肠腺瘤、结肠梗阻、便血；直肠癌、肛管癌、直肠腺瘤、直肠息肉、内痔、外痔、混合痔、肛瘘、肛周脓肿。

本中心特色医疗：腹腔镜结直肠手术（包括结肠癌、直肠癌，结直肠腺瘤、结肠多发性息肉）；吻合器痔上黏膜环切术（包括环状混合痔、直肠黏膜脱垂）；微波痔治疗术（单个内痔）。